30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3327 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  100 
 
 		 82 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  92.68 
 
 		 82 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  79.27 
 
 		 82 aa  136  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  75 
 
 		 73 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  68.29 
 
 		 82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  65.48 
 
 		 84 aa  113  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  65.79 
 
 		 84 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  69.57 
 
 		 77 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  62.34 
 
 		 77 aa  98.6  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  59.21 
 
 		 179 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  65.15 
 
 		 71 aa  91.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  53.62 
 
 		 90 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  59.65 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  48.61 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  47.89 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  54.41 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  49.3 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  38.46 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  43.94 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  34.62 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  44.44 
 
 		 90 aa  50.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  46.3 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  35.21 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  38.1 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  38.46 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  27.4 
 
 		 80 aa  41.2  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2822  hypothetical protein  36.21 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>