37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2102 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2102  protein of unknown function DUF264  100 
 
 		 386 aa  765    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000296249  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3472  hypothetical protein  79.79 
 
 		 431 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1976  hypothetical protein  78.11 
 
 		 370 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.493623  normal  0.545091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1800  hypothetical protein  69.69 
 
 		 423 aa  534  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.983484  normal  0.0740588 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3147  hypothetical protein  69.17 
 
 		 416 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.284595  normal  0.0189351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1160  hypothetical protein  68.13 
 
 		 422 aa  518  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1964  hypothetical protein  66.84 
 
 		 386 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.817651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1408  hypothetical protein  67.36 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3490  hypothetical protein  65.54 
 
 		 423 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0585  terminase large subunit, putative  63.19 
 
 		 384 aa  466  9.999999999999999e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4961  hypothetical protein  65.12 
 
 		 432 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000421894 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0586  putative terminase large subunit  62.66 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1330  large terminase  61.66 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1708  protein of unknown function DUF264  64.43 
 
 		 421 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.0322658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1430  protein of unknown function DUF264  65.21 
 
 		 421 aa  448  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.396368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1434  hypothetical protein  64.43 
 
 		 458 aa  442  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.834365 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3704  hypothetical protein  55.17 
 
 		 446 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2178  hypothetical protein  55.82 
 
 		 452 aa  397  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1631  hypothetical protein  53.87 
 
 		 483 aa  385  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.576046  normal  0.91477 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1074  hypothetical protein  55.47 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541704  normal  0.984253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0902  hypothetical protein  58.55 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.225304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2467  putative large terminase  55.29 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1129  hypothetical protein  55.29 
 
 		 414 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.918879  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2902  hypothetical protein  55.03 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176162  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1057  hypothetical protein  53.68 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0533808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0918  hypothetical protein  53.28 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.415062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  49.87 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2004  hypothetical protein  50.9 
 
 		 436 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0120622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3118  hypothetical protein  50.91 
 
 		 440 aa  323  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  44.8 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3043  protein of unknown function DUF264  42.34 
 
 		 435 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2716  Phage uncharacterized protein-like  47.52 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3628  hypothetical protein  42.66 
 
 		 690 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0633  hypothetical protein  31.42 
 
 		 509 aa  145  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3483  hypothetical protein  30.75 
 
 		 453 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0384  hypothetical protein  49.44 
 
 		 426 aa  90.1  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.22896  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  31.52 
 
 		 496 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>