12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1084 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1084  protein of unknown function DUF1520  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0196  hypothetical protein  50.22 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3424  hypothetical protein  41.51 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4837  hypothetical protein  37.62 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00868902  normal  0.100202 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4587  hypothetical protein  38.61 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0375188  normal  0.913544 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4908  hypothetical protein  36.63 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4888  hypothetical protein  33.02 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.503138  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1989  hypothetical protein  30.53 
 
 		 172 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1147  hypothetical protein  32.23 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2271  hypothetical protein  28.3 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.994316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1246  hypothetical protein  27.36 
 
 		 171 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2113  hypothetical protein  27.34 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>