14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2591 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2591  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4242  hypothetical protein  63.46 
 
 		 439 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3828  protein of unknown function DUF324  63.26 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3923  hypothetical protein  62.07 
 
 		 169 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0931  protein of unknown function DUF324  45.41 
 
 		 423 aa  172  7.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0413017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1354  hypothetical protein  39.72 
 
 		 364 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00474822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1987  protein of unknown function DUF324  46.67 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.920046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0804  protein of unknown function DUF324  38.74 
 
 		 376 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505902  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0913  protein of unknown function DUF324  40.31 
 
 		 363 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3814  protein of unknown function DUF324  34.26 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.173062  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0314  hypothetical protein  30.91 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  23.4 
 
 		 282 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0567  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  26.49 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123695  hitchhiker  0.00248457 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2975  CRISPR-associated RAMP protein, Cmr6 family  25.73 
 
 		 391 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.506126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>