17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1439 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1439  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  461  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111191 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0981  protein of unknown function DUF324  36.32 
 
 		 237 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1804  hypothetical protein  29 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0740  hypothetical protein  34.17 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0101279  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2385  hypothetical protein  25.41 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5584  protein of unknown function DUF324  28.19 
 
 		 649 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2051  CRISPR-associated Csm3 family protein  24.09 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1287  CRISPR-associated Csm3 family protein  27.78 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.609283  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1442  CRISPR-associated Csm3 family protein  23.53 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141545 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2054  hypothetical protein  22.51 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0744  hypothetical protein  24.29 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0162344  normal  0.584982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0368  hypothetical protein  27.98 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100802 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0191  hypothetical protein  26.74 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.667263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0610  CRISPR-associated RAMP protein, Csm3 family  28.18 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1293  hypothetical protein  27.68 
 
 		 288 aa  42.4  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3292  hypothetical protein  29.55 
 
 		 622 aa  41.6  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.798448 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0739  hypothetical protein  27.4 
 
 		 429 aa  41.6  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0332728  normal  0.187894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>