17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0493 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0493  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 
342 aa  674    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  49.56 
 
 
339 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1734  Vitamin K epoxide reductase  41.55 
 
 
145 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  38.89 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1249  hypothetical protein  71.43 
 
 
89 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  37.18 
 
 
377 aa  60.1  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1588  hypothetical protein  31.82 
 
 
288 aa  59.7  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0611  vitamin K epoxide reductase  33.82 
 
 
166 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  37.5 
 
 
553 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  27.01 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  34.31 
 
 
164 aa  48.1  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48122  predicted protein  27.4 
 
 
366 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  28.67 
 
 
301 aa  46.6  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  32.24 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  35.07 
 
 
142 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38289  predicted protein  34.15 
 
 
303 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0660789  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0234  Vitamin K epoxide reductase  32.45 
 
 
310 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>