23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0264 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0264  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  7.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4281  hypothetical protein  45.1 
 
 		 172 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0720586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0938  hypothetical protein  45.75 
 
 		 174 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.156043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  28.37 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  26.77 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  29.55 
 
 		 257 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  26.76 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  29.45 
 
 		 183 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  26.8 
 
 		 244 aa  48.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  24.83 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  27.4 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.67 
 
 		 241 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  27.69 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  25.64 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  25.98 
 
 		 184 aa  45.8  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0255  protein of unknown function DUF820  26.95 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911241 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  25.93 
 
 		 190 aa  44.3  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  24.09 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  25.95 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2963  protein of unknown function DUF820  24.82 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  40.8  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  28.76 
 
 		 207 aa  40.8  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0111361 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>