14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1600 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  68.08 
 
 		 612 aa  771    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 610 aa  1215    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  42.41 
 
 		 636 aa  469  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  45.67 
 
 		 620 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  45.5 
 
 		 620 aa  458  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  43.06 
 
 		 621 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  38.34 
 
 		 631 aa  398  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  39.75 
 
 		 634 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  37.19 
 
 		 650 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  31.9 
 
 		 644 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 649 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 630 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  26.38 
 
 		 650 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  38.3 
 
 		 687 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>