43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0877 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  440  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  74.36 
 
 		 223 aa  307  6.999999999999999e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  52.06 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  48.88 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  50.48 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  42.18 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  43.08 
 
 		 234 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  38.21 
 
 		 236 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  39.15 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  39.15 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  39.15 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  39.8 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  39.62 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  40.93 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  38.6 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  38.6 
 
 		 236 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  27.54 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  28.82 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  29.41 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  28.85 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0555  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.824529  normal  0.88861 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  28.33 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  28.73 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  30.05 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0973  hypothetical protein  27.03 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  27.57 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  26.55 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  26.55 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  27.03 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  26.98 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>