22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2867 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0108  hypothetical protein  50.77 
 
 
68 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  47.06 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  42.37 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  41.27 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  42.37 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  41.03 
 
 
70 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  47.06 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  47.06 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  44.19 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  41.67 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  47.73 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  48.98 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0573  hypothetical protein  37.93 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  39.22 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  44.9 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  43.59 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0256  hypothetical protein  33.85 
 
 
65 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  41.18 
 
 
60 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2116  hypothetical protein  31.25 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0721  hypothetical protein  31.25 
 
 
69 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.205561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2141  hypothetical protein  29.69 
 
 
69 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>