23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0733 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 65 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  64.81 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  54.9 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  49.06 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  44.83 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  45 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1463  hypothetical protein  43.55 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  34.92 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  44.23 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  35.38 
 
 		 66 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  40.98 
 
 		 66 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  43.86 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  47.06 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0450  hypothetical protein  29.23 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000414682  normal  0.357925 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.802292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2116  hypothetical protein  33.33 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  38.6 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.205561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>