16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0589 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  46.15 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  40.35 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  43.86 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  40 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  38.89 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  38.89 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  33.93 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  41.67 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  48.84 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1463  hypothetical protein  42.31 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  36 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  42.22 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  38.46 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>