23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1857 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  138  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  64.81 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  64.81 
 
 
65 aa  78.2  0.00000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  47.14 
 
 
70 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  45.61 
 
 
60 aa  60.5  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  49.02 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  45.28 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  46.15 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  41.51 
 
 
66 aa  52  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1463  hypothetical protein  36.92 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  37.74 
 
 
66 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  38.46 
 
 
68 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  34.33 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2116  hypothetical protein  30.88 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2141  hypothetical protein  30.88 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0108  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  39.22 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0721  hypothetical protein  29.41 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.205561  n/a   
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  44 
 
 
65 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2137  hypothetical protein  40.48 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.802292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  36 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>