13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2141 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2141  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  143  8.000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2116  hypothetical protein  98.55 
 
 		 70 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0721  hypothetical protein  95.65 
 
 		 69 aa  140  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.205561  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0450  hypothetical protein  47.62 
 
 		 65 aa  74.7  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000414682  normal  0.357925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0256  hypothetical protein  40.62 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0573  hypothetical protein  49.02 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0096  hypothetical protein  34.38 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.410091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  38.89 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  30.88 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0108  hypothetical protein  31.82 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2867  hypothetical protein  29.69 
 
 		 78 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>