21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2060 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  35.63 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  36.13 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  34.76 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  35.15 
 
 		 169 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  35.22 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  30.12 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  32.1 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  30.19 
 
 		 167 aa  69.7  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  29.68 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  30.32 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_002950  PG0147  hypothetical protein  26.71 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  27.85 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  29.38 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1414  hypothetical protein  28.48 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000639051  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  27.16 
 
 		 172 aa  47.8  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1847  hypothetical protein  24.53 
 
 		 172 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0604  hypothetical protein  24.1 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  24.68 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>