19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1968 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  58.58 
 
 		 169 aa  210  7e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  54.04 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  51.88 
 
 		 168 aa  171  5.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  49.69 
 
 		 169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  49.67 
 
 		 166 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  44.65 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  36.13 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  26.11 
 
 		 167 aa  67.4  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  28.4 
 
 		 188 aa  67  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  34.68 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  28.12 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  25.61 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0604  hypothetical protein  28.32 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  27.21 
 
 		 175 aa  51.2  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.845056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  30.56 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1847  hypothetical protein  26.97 
 
 		 172 aa  49.3  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0147  hypothetical protein  21.11 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>