17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2004 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  340  4e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  47.83 
 
 
169 aa  174  4e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  50.3 
 
 
168 aa  174  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  49.69 
 
 
178 aa  171  5.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  45.96 
 
 
169 aa  160  9e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  44.67 
 
 
166 aa  139  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1638  hypothetical protein  38.75 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  35.22 
 
 
180 aa  100  8e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  28.74 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  29.61 
 
 
188 aa  69.3  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  30.82 
 
 
167 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  26.45 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  25.61 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0604  hypothetical protein  27.54 
 
 
178 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  29.34 
 
 
163 aa  54.7  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  26.63 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2357  hypothetical protein  20.28 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.845056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>