20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1823 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1823  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  363  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0953844 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0989  hypothetical protein  39.89 
 
 
188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2729  hypothetical protein  36.42 
 
 
164 aa  119  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0313  hypothetical protein  34.57 
 
 
163 aa  98.6  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.686575  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0604  hypothetical protein  35.06 
 
 
178 aa  95.1  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0147  hypothetical protein  29.34 
 
 
179 aa  90.1  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5918  hypothetical protein  31.01 
 
 
171 aa  87  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000939789  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00690  hypothetical protein  31.82 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1799  hypothetical protein  25.57 
 
 
168 aa  69.3  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.429868 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2060  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0247  hypothetical protein  28.03 
 
 
167 aa  66.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1968  hypothetical protein  33.82 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000000218249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2004  hypothetical protein  28.68 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1999  hypothetical protein  28.24 
 
 
169 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0414  hypothetical protein  27.04 
 
 
166 aa  55.1  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.683154  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2332  hypothetical protein  24.42 
 
 
169 aa  50.8  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000503232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2115  lipoprotein, putative  26.17 
 
 
167 aa  48.5  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3133  hypothetical protein  25.15 
 
 
172 aa  45.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0114164  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0202  hypothetical protein  22.76 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>