14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1463 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1463  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  148  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  41.51 
 
 
70 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  43.55 
 
 
65 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  43.55 
 
 
65 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  36.92 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  47.17 
 
 
65 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2463  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53546  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  41.54 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  35.85 
 
 
66 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5547  hypothetical protein  34.62 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.868825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0589  hypothetical protein  42.31 
 
 
64 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.112299  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2137  hypothetical protein  44.68 
 
 
87 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.802292 
 
 
-
 
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  43.14 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  36.51 
 
 
68 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>