18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3628 on replicon NC_009473
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009473  Acry_3628  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3626  hypothetical protein  81.67 
 
 
66 aa  104  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.218779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2326  hypothetical protein  50 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2601  hypothetical protein  45.1 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00023523  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1969  hypothetical protein  45.1 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.313407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0450  hypothetical protein  35.59 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000414682  normal  0.357925 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4996  hypothetical protein  44.9 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565359  normal  0.302172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1312  hypothetical protein  36.36 
 
 
60 aa  45.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.400189  normal  0.266192 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0591  hypothetical protein  41.18 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0887  hypothetical protein  42.86 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0270  hypothetical protein  44.44 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.539456  normal  0.847798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3223  hypothetical protein  38.78 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.133726  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1857  hypothetical protein  44 
 
 
71 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.434707  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0582  hypothetical protein  38.6 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0733  hypothetical protein  38.6 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000840399 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2138  hypothetical protein  40.74 
 
 
64 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.183994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1463  hypothetical protein  43.14 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2137  hypothetical protein  32.69 
 
 
87 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.802292 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>