88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1337 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1337  thiamineS protein  100 
 
 
87 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.584226  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2057  molybdopterin synthase subunit MoaD / molybdopterin synthase subunit MoaE  41.98 
 
 
228 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0334  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
233 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.86513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.51 
 
 
223 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4347  thiamineS  30.59 
 
 
92 aa  57.4  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.022503  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3329  MoaD family protein  36.9 
 
 
88 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0132  thiamineS protein  36.71 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0225  molybdopterin converting factor, subunit 1  37.04 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000241588  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4226  MoaD family protein  33.33 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139211  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4187  MoaD family protein  33.33 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2136  molybdopterin synthase subunit MoaE / molybdopterin synthase subunit MoaD  43.21 
 
 
248 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1889  MoaD family protein  33.33 
 
 
86 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000141172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13354  moaD-moaE fusion protein moaX  34.57 
 
 
221 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00273279  normal  0.249285 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5522  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.44 
 
 
216 aa  52.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2923  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.253971  normal  0.914332 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4550  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.51 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.8 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3195  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
238 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  32.1 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0159  thiamineS protein  41.98 
 
 
79 aa  50.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.55 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1586  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.33 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1302  thiamineS  33.33 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115817  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4831  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1180  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.71 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0405  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1248  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.71 
 
 
217 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4729  MoaD family protein  35.8 
 
 
221 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.554846  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4837  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4861  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4469  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4855  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
77 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4451  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.51 
 
 
77 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2295  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.269052  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2337  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.9 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4615  molybdopterin converting factor subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1759  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.27 
 
 
222 aa  48.1  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.940136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4971  molybdopterin converting factor subunit 1  39.24 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.210514  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.33 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.33 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13129  molybdenum cofactor biosynthesis protein D moaD1  35.37 
 
 
83 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.139551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.56 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.52 
 
 
83 aa  47  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3301  molybdopterin biosynthesis MoaE protein  33.33 
 
 
227 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.387629  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1587  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.25 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.56 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0111  molybdopterin converting factor, subunit 1  33.72 
 
 
235 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129996  normal  0.207876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2552  molybdopterin converting factor, subunit 1  35 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3391  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3358  molybdopterin converting factor subunit 1  36.36 
 
 
88 aa  43.5  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.617714  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0649  MoaD family protein  29.63 
 
 
229 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.321088  hitchhiker  0.00441005 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3621  molybdopterin converting factor subunit 1  35.44 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.954935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.49 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  34.15 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1174  thiamineS protein  32.91 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3579  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3589  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2280  molydbenum cofactor biosynthesis protein D  39.02 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.94 
 
 
85 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  36.9 
 
 
83 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1963  molybdopterin biosynthesis protein, subunit D  32.91 
 
 
77 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0016  MoaD family protein  34.88 
 
 
92 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.767605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3322  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.06 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3272  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.06 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  30.49 
 
 
84 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3572  molybdopterin converting factor, subunit 1  34.18 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1089  thiamineS protein  35.8 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  37.35 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1029  molybdopterin synthase small subunit  35.8 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2001  MoaD family protein  30.86 
 
 
228 aa  41.6  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0975  molybdopterin converting factor, subunit 1  35.8 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.9 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1941  molybdopterin biosynthesis protein, subunit D  32.91 
 
 
77 aa  40.8  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2170  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2360  thiamineS protein  33.33 
 
 
85 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0708  thiamineS  27.16 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2078  GTP cyclohydrolase subunit MoaC  38.1 
 
 
262 aa  40.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00767498  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.94 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0825  MoaD family protein  30.77 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.145179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1989  molybdopterin converting factor subunit 1  32.91 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0155681  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0847  molybdopterin synthase small subunit  37.04 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.277735  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0932  molybdopterin synthase small subunit  38.27 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2137  molybdopterin converting factor subunit 1  32.91 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1645  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.91 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  31.33 
 
 
83 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>