62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5273 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5273  phage shock protein A, PspA  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0710942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5545  phage shock protein A, PspA  91.39 
 
 		 244 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.892809 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5368  hypothetical protein  85.54 
 
 		 253 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.813565  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3389  phage shock protein A, PspA  40.44 
 
 		 231 aa  150  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1404  phage shock protein A, PspA  39.66 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.792709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5044  phage shock protein A, PspA  39.91 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3786  PspA/IM30 family protein  39.39 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.634391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1693  PspA/IM30  39.39 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.509577  normal  0.622642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01340  Phage shock protein A (IM30), suppresses sigma54-dependent transcription  36.12 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4191  PspA/IM30 family protein  36.4 
 
 		 229 aa  129  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3822  phage shock protein A, PspA  37.39 
 
 		 236 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.302506  normal  0.194258 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1388  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0883629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16150  hypothetical protein  36.89 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1224  phage shock protein A, PspA  33.92 
 
 		 226 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02185  PspA/IM30 family protein  34.36 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3703  phage shock protein A, PspA  36.56 
 
 		 232 aa  118  7e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3479  ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6  33.48 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.111551  normal  0.0139812 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0185  phage shock protein A, PspA  32.14 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2668  PspA/IM30  33.48 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.638244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3114  phage shock protein A, PspA  34.2 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.139469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0858  phage shock protein A, PspA  34.2 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.69065  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0827  phage shock protein A, PspA  33.04 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0623  phage shock protein A, PspA  32.46 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.865812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3091  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0777554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0888  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0922  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0912  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0749469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3450  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.613908  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3765  hypothetical protein  32.61 
 
 		 229 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3482  phage shock protein A, PspA  31.58 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0916026  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0722  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000273053  hitchhiker  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3266  phage shock protein A, PspA  31.14 
 
 		 229 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.942546  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3838  phage shock protein A, PspA  30.7 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.867887  unclonable  0.00000000015087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0697  PspA/IM30  31.58 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000488945  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4653  PspA/IM30 family protein  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.618876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04011  hypothetical protein  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3811  phage shock protein A, PspA  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3831  phage shock protein A, PspA  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000771014 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04049  predicted transcriptional regulator effector protein  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4742  PspA/IM30 family protein  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.473518  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4426  PspA/IM30 family protein  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4649  PspA/IM30 family protein  31.86 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5698  PspA/IM30 family protein  33.33 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4789  PspA/IM30 family protein  31.42 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4768  PspA/IM30 family protein  31.42 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4732  PspA/IM30 family protein  31.42 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.783579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1637  phage shock protein A, PspA  28.26 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0677  phage shock protein A, PspA  29.07 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.274325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0333  phage shock protein A, PspA  23.22 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0216  phage shock protein A, PspA  25 
 
 		 222 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1754  phage shock protein PspA  26.02 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0735  phage shock protein A, PspA  26.67 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.320834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2610  phage shock protein PspA  24.9 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0101575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2335  phage shock protein PspA  24.9 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1006  hypothetical protein  22.41 
 
 		 246 aa  45.4  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.682197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3183  phage shock protein A, PspA  37.23 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.170876  normal  0.95857 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1621  phage shock protein A, PspA  23.47 
 
 		 297 aa  43.9  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.615418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2993  phage shock protein A, PspA  26.52 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.403474  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3152  PspA/IM30 family protein  24.9 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2957  PspA/IM30 family protein  37.76 
 
 		 230 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0635667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1722  phage shock protein PspA  25.7 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1604  phage shock protein A, PspA  28.4 
 
 		 224 aa  42  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>