29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1524 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1524  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00756451  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1197  PilT domain-containing protein  32.95 
 
 		 187 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.814698  normal  0.467575 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2534  PilT protein, N-terminal  27.27 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.641844  normal  0.62652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3962  PilT domain-containing protein  31.47 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3697  PilT protein domain protein  30.82 
 
 		 138 aa  51.6  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2873  PilT protein domain protein  29.37 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2733  PilT protein-like  29.81 
 
 		 145 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.489446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0792  nucleic acid binding protein  33.03 
 
 		 155 aa  48.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.705991  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0871  putative plasmid stability-like protein  29.05 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.852163  normal  0.0312935 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1545  plasmid stabilization protein StbB-like  27.89 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762824 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4028  PilT protein domain protein  28.66 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5170  PilT protein domain protein  29.19 
 
 		 147 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2839  nucleic acid-binding protein contains PIN domain  27.89 
 
 		 140 aa  45.8  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.454124  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4565  PilT protein domain protein  27.21 
 
 		 140 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2039  PilT domain-containing protein  25.52 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.837298  normal  0.704455 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4538  PilT protein domain protein  25.17 
 
 		 140 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.104439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0013  PilT protein-like  29.37 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1880  PilT-type plasmid stability protein  28.19 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1780  plasmid stability protein, putative  36.62 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1999  PIN domain protein  25.35 
 
 		 150 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0463072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1456  PilT protein domain protein  36.62 
 
 		 139 aa  42.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.208651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3521  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1214  PilT domain-containing protein  33.33 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4182  PilT domain-containing protein  25.52 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3333  PilT domain-containing protein  25.52 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4833  PilT protein-like  25.52 
 
 		 139 aa  41.6  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1229  hypothetical protein  23.03 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11632  normal  0.418302 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0857  PilT protein  27.21 
 
 		 140 aa  41.6  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.159356 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5181  PilT domain-containing protein  27.03 
 
 		 136 aa  41.2  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>