20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6189 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6189  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  814    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165086 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4925  hypothetical protein  94.18 
 
 
396 aa  780    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0193  hypothetical protein  77.2 
 
 
398 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1047  hypothetical protein  76.38 
 
 
398 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.947339  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0772  hypothetical protein  80.41 
 
 
403 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.447224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2857  hypothetical protein  80.67 
 
 
403 aa  649    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3811  hypothetical protein  86.84 
 
 
396 aa  729    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0478  hypothetical protein  77.92 
 
 
401 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2348  hypothetical protein  74.05 
 
 
398 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.231215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0570  hypothetical protein  76.03 
 
 
398 aa  621  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.23466  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4578  hypothetical protein  75.25 
 
 
397 aa  622  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4026  hypothetical protein  73.3 
 
 
397 aa  610  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.262825  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2780  hypothetical protein  73.55 
 
 
397 aa  610  1e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1467  hypothetical protein  73.51 
 
 
402 aa  592  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1544  hypothetical protein  48.89 
 
 
402 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.885517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0841  hypothetical protein  88.54 
 
 
167 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.586308  hitchhiker  0.00403969 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4145  hypothetical protein  76.88 
 
 
235 aa  281  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0608  two component transcriptional regulator  69.35 
 
 
393 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4137  hypothetical protein  62.26 
 
 
172 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.339892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0283  hypothetical protein  24.61 
 
 
318 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>