27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3496 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3496  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  649    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0101  hypothetical protein  61.18 
 
 		 313 aa  391  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.170875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2080  hypothetical protein  57.76 
 
 		 313 aa  361  9e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.246474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1804  hypothetical protein  59.87 
 
 		 320 aa  358  7e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.983819 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1224  hypothetical protein  58.2 
 
 		 313 aa  351  8.999999999999999e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1102  hypothetical protein  54.18 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0722  hypothetical protein  55.52 
 
 		 322 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480992  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2833  hypothetical protein  56.16 
 
 		 294 aa  332  6e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000938747  normal  0.0171751 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1470  hypothetical protein  52.65 
 
 		 318 aa  328  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2490  hypothetical protein  52.01 
 
 		 321 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0547  hypothetical protein  58.67 
 
 		 318 aa  317  1e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.47713 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1866  hypothetical protein  54.33 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.786174  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1972  hypothetical protein  52.7 
 
 		 298 aa  308  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0491  hypothetical protein  46.31 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106811  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0561  hypothetical protein  47.9 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0564  hypothetical protein  47.19 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2529  hypothetical protein  44.44 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0158591  normal  0.0615713 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0532  hypothetical protein  46.03 
 
 		 314 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4098  hypothetical protein  43.88 
 
 		 319 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  0.84222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2601  hypothetical protein  44.33 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00160673  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5413  hypothetical protein  43.15 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8237  hypothetical protein  39.8 
 
 		 331 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1972  hypothetical protein  37.37 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.238545 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1603  hypothetical protein  28.37 
 
 		 298 aa  133  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0178539  hitchhiker  0.0000000381472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3033  hypothetical protein  27.78 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00644621  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0048  hypothetical protein  63.16 
 
 		 53 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0967  hypothetical protein  41.82 
 
 		 114 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>