14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1356 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1356  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0235226  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2655  hypothetical protein  42.13 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2679  hypothetical protein  39.44 
 
 		 190 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16910  hypothetical protein  43.33 
 
 		 169 aa  114  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2001  hypothetical protein  35.2 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2987  hypothetical protein  33.9 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000055381  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8746  hypothetical protein  32.73 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8816  hypothetical protein  29.26 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  39.81 
 
 		 315 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4092  hypothetical protein  33.63 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0391  hypothetical protein  32.11 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6989  hypothetical protein  31.36 
 
 		 318 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0586  hypothetical protein  36.36 
 
 		 97 aa  44.7  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>