17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0242 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0242  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  825    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1137  hypothetical protein  75.64 
 
 		 444 aa  601  1.0000000000000001e-171  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0252196  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3891  hypothetical protein  77.13 
 
 		 394 aa  597  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2424  hypothetical protein  53.02 
 
 		 391 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.481208  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1793  hypothetical protein  53.56 
 
 		 391 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0265229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3274  HAD family hydrolase  31.71 
 
 		 698 aa  175  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.258602  normal  0.120543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1828  glycogen debranching protein  29.86 
 
 		 458 aa  160  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2516  glycogen debranching enzyme-like protein  30.98 
 
 		 445 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1537  hypothetical protein  27.3 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.522426  normal  0.175013 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01235  hypothetical protein  24.02 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4707  neutral invertase  24.11 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2313  neutral invertase  29.5 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.314535 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0707  neutral invertase  29.17 
 
 		 474 aa  50.8  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.3299  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1522  Amylo-alpha-1,6-glucosidase  24.45 
 
 		 565 aa  49.7  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.644798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0609  neutral invertase  24.55 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00065977  normal  0.697444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3724  hypothetical protein  22.59 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.0430352 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2703  Amylo-alpha-16-glucosidase  26.21 
 
 		 751 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.690991  normal  0.724789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>