16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4205 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4205  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  422  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1219  hypothetical protein  50.7 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1490  hypothetical protein  34.63 
 
 		 211 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.687468  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0086  putative lipoprotein  27.78 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0126  putative lipoprotein  27.87 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1191  membrane lipoprotein lipid attachment site  23.74 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00328821  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2514  putative lipoprotein  26.09 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5474  putative lipoprotein  25.14 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0836  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.92 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0143317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0637  hypothetical protein  26.92 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0353203  normal  0.98697 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2065  putative lipoprotein  22.67 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.274451  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0964  membrane lipoprotein lipid attachment site  26.62 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0219897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1812  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2333  hypothetical protein  26.32 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000127187  normal  0.606412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0914  hypothetical protein  26.28 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.310752  normal  0.0133601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3851  membrane lipoprotein lipid attachment site  22.3 
 
 		 199 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.160992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>