50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3830 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B3830  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  394  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2539  hypothetical protein  52.49 
 
 
190 aa  185  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.421642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2721  hypothetical protein  43.35 
 
 
213 aa  147  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0468  hypothetical protein  40.68 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0529  hypothetical protein  37.85 
 
 
224 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0170564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3745  hypothetical protein  37.16 
 
 
190 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0742  hypothetical protein  38.6 
 
 
194 aa  99.8  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0553  hypothetical protein  37.57 
 
 
208 aa  99.4  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0374  hypothetical protein  34.24 
 
 
182 aa  98.2  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0457  hypothetical protein  40.68 
 
 
208 aa  97.8  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0473  hypothetical protein  40.68 
 
 
208 aa  97.8  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0378  hypothetical protein  35.71 
 
 
180 aa  97.4  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2436  hypothetical protein  35.84 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.774495  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6665  hypothetical protein  33.69 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742251  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1755  hypothetical protein  39.26 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0946403  normal  0.917743 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1967  hypothetical protein  39.26 
 
 
186 aa  90.5  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.555047  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0518  hypothetical protein  35.23 
 
 
185 aa  89.4  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6186  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327018  normal  0.86985 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5821  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  88.6  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5536  hypothetical protein  30.18 
 
 
192 aa  88.6  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7732  hypothetical protein  32.09 
 
 
194 aa  88.2  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4883  hypothetical protein  36.84 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0333  hypothetical protein  33.7 
 
 
199 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000989305  hitchhiker  0.00834718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2081  hypothetical protein  33.33 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1173  hypothetical protein  33.16 
 
 
187 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.137716 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2674  hypothetical protein  36.41 
 
 
261 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2679  hypothetical protein  35.59 
 
 
202 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806298  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0974  hypothetical protein  36.41 
 
 
252 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0274  hypothetical protein  36.41 
 
 
252 aa  85.5  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2402  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0812  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0816  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.313298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0015  hypothetical protein  36.41 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5977  hypothetical protein  35.59 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0652  hypothetical protein  33.52 
 
 
223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2571  hypothetical protein  35.59 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2039  hypothetical protein  33.52 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5762  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.443693  normal  0.551739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2650  hypothetical protein  33.52 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2697  hypothetical protein  35.59 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6007  hypothetical protein  33.15 
 
 
194 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.245957  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0645  hypothetical protein  35.08 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6156  hypothetical protein  32.98 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.159993  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1574  hypothetical protein  29.51 
 
 
186 aa  81.6  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00452376 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3293  hypothetical protein  31.25 
 
 
246 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.430478  normal  0.990698 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0673  hypothetical protein  32.46 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.305668 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6760  hypothetical protein  32.79 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0442  hypothetical protein  34.62 
 
 
245 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1183  hypothetical protein  27.88 
 
 
161 aa  58.9  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2400  hypothetical protein  28.37 
 
 
153 aa  57.8  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.763825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>