30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2388 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1048  phage uncharacterized protein  72.13 
 
 
516 aa  754    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0343018  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2388  Phage uncharacterized protein, C-terminal  100 
 
 
516 aa  1065    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1307  hypothetical protein  72.76 
 
 
505 aa  741    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2266  phage uncharacterized protein  89.92 
 
 
512 aa  931    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.830679  hitchhiker  0.000265113 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2225  phage uncharacterized protein  35.82 
 
 
547 aa  323  5e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0340068  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1212  phage uncharacterized protein  40.09 
 
 
461 aa  320  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3004  Phage uncharacterized protein-like  35.34 
 
 
484 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0302  chaperone and heat shock protein 70  34.8 
 
 
484 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.763978  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0377  Phage uncharacterized protein, C-terminal  29 
 
 
469 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0430074  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1184  Phage uncharacterized protein-like  30.35 
 
 
493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0665  phage uncharacterized protein  28.35 
 
 
469 aa  169  1e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.410967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0814  phage uncharacterized protein  28.63 
 
 
451 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.93566  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1016  phage uncharacterized protein  29.35 
 
 
487 aa  163  6e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0660227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0801  Phage uncharacterized protein-like  29.42 
 
 
466 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.814229  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0967  phage uncharacterized protein  26.27 
 
 
465 aa  135  1.9999999999999998e-30  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.451476  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0804  phage uncharacterized protein  28.37 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0224  phage uncharacterized protein  26.6 
 
 
488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  28.37 
 
 
913 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3556  phage uncharacterized protein  24.85 
 
 
490 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1132  phage uncharacterized protein  34.02 
 
 
295 aa  110  7.000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6558  phage uncharacterized protein  28.73 
 
 
494 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0181003  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6997  phage uncharacterized protein  23.95 
 
 
491 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5956  phage uncharacterized protein  26.71 
 
 
456 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.114161  normal  0.0123873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6256  hypothetical protein  25.93 
 
 
492 aa  89  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2507  phage uncharacterized protein  23.41 
 
 
461 aa  73.9  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0014  hypothetical protein  22.49 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0542  phage uncharacterized protein  25.94 
 
 
495 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0957  hypothetical protein  21.63 
 
 
469 aa  60.5  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000035245 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3888  hypothetical protein  26.01 
 
 
496 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2841  phage uncharacterized protein  24.48 
 
 
522 aa  52  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>