15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4242 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4242  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  892    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.339466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3828  protein of unknown function DUF324  93.15 
 
 		 439 aa  786    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000223415 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2591  hypothetical protein  63.46 
 
 		 331 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1354  hypothetical protein  37.83 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00474822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0931  protein of unknown function DUF324  37.79 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0413017  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1987  protein of unknown function DUF324  38.89 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.920046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0804  protein of unknown function DUF324  40.15 
 
 		 376 aa  169  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.505902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3923  hypothetical protein  60.54 
 
 		 169 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal  0.0669339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0314  hypothetical protein  31.2 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0913  protein of unknown function DUF324  41.5 
 
 		 363 aa  144  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3814  protein of unknown function DUF324  36.53 
 
 		 325 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.173062  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1514  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  22.91 
 
 		 282 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0589166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0631  CRISPR-associated RAMP Cmr6 family protein  29.5 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.296132  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0975  hypothetical protein  23.56 
 
 		 220 aa  45.8  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0171126  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1629  CRISPR-associated RAMP Csm3 family protein  27.22 
 
 		 215 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>