16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2926 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2926  hypothetical protein  100 
 
 
198 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0687011  normal  0.364425 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3264  hypothetical protein  56.57 
 
 
203 aa  212  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.210051  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6058  putative secreted protein  31.14 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.18799 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03964  hypothetical protein  33.33 
 
 
247 aa  62.8  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4908  hypothetical protein  32.21 
 
 
232 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6057  hypothetical protein  30 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.091793 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6321  putative secreted protein  29.08 
 
 
259 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.442981 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6498  putative secreted protein  27.66 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6733  putative secreted protein  27.66 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.591517  normal  0.863761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3455  hypothetical protein  30.94 
 
 
270 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2056  putative secreted protein  31.4 
 
 
219 aa  47.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03963  hypothetical protein  32.76 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6497  hypothetical protein  25.95 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6732  hypothetical protein  25.95 
 
 
182 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.921857  normal  0.835768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0170  hypothetical protein  25.3 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.265836  hitchhiker  0.00120462 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6320  hypothetical protein  23.85 
 
 
182 aa  42.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463448  normal  0.556434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>