23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2650 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2650  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  711    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1569  hypothetical protein  86.97 
 
 
353 aa  628  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6760  hypothetical protein  33.63 
 
 
331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0200  hypothetical protein  31.1 
 
 
333 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1318  hypothetical protein  32.7 
 
 
332 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.444184  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21680  hypothetical protein  33.59 
 
 
335 aa  99  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.2828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0080  hypothetical protein  30.65 
 
 
336 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.723937  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2433  hypothetical protein  37.34 
 
 
332 aa  95.9  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  31.6 
 
 
348 aa  89  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2104  hypothetical protein  29.52 
 
 
334 aa  87  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3215  hypothetical protein  36.99 
 
 
379 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000550519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0257  hypothetical protein  37.62 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.851518  hitchhiker  0.00111717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1844  hypothetical protein  32.87 
 
 
346 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3934  hypothetical protein  36.79 
 
 
350 aa  76.6  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0423  hypothetical protein  29.29 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0177  hypothetical protein  37.38 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022221 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0312  hypothetical protein  38.46 
 
 
594 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0329  hypothetical protein  36.54 
 
 
594 aa  67.8  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4513  hypothetical protein  35.81 
 
 
324 aa  65.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3440  hypothetical protein  24.55 
 
 
355 aa  63.5  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00117447  normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0114  hypothetical protein  33.1 
 
 
164 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0101503  hitchhiker  0.00333564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5160  hypothetical protein  34.9 
 
 
523 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.417539  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0191  hypothetical protein  29.79 
 
 
182 aa  43.5  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>