15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1560 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1560  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  214  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1972  hypothetical protein  86.84 
 
 		 114 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0274003  normal  0.368977 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5063  hypothetical protein  37.66 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000118221  normal  0.831362 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3360  hypothetical protein  40.54 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3359  hypothetical protein  39.74 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4696  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0776078  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2076  hypothetical protein  36.62 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.186407  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4165  hypothetical protein  36.23 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4204  hypothetical protein  36.23 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3002  hypothetical protein  39.74 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3117  hypothetical protein  39.74 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0045793  normal  0.84646 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2573  hypothetical protein  35.44 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.463071  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4695  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0032  hypothetical protein  32.1 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.199385  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1570  hypothetical protein  34.94 
 
 		 139 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>