12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0948 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  347  4e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  92.53 
 
 		 174 aa  327  4e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  33.78 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.85 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  24.79 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  44 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  35.11 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  37.18 
 
 		 180 aa  41.6  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.99 
 
 		 291 aa  41.2  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  30.99 
 
 		 283 aa  40.8  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  37.18 
 
 		 175 aa  41.2  0.008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>