19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2286 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2286  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3151  hypothetical protein  49.51 
 
 		 312 aa  315  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1128  hypothetical protein  50.16 
 
 		 312 aa  311  5.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0995  hypothetical protein  54.85 
 
 		 316 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2381  hypothetical protein  40.45 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2528  hypothetical protein  40.76 
 
 		 310 aa  258  9e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0849  hypothetical protein  40.3 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4745  hypothetical protein  41.13 
 
 		 123 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  30.66 
 
 		 204 aa  50.1  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 360 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  27.72 
 
 		 265 aa  46.2  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1073  Methyltransferase type 12  43.08 
 
 		 257 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.564259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 		 222 aa  45.8  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 282 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 224 aa  43.5  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  38.96 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 204 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  32.92 
 
 		 284 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2284  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 248 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>