43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0799 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0799  putative purine nucleoside permease protein  100 
 
 		 346 aa  711    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0816  purine nucleoside permease  91.1 
 
 		 349 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0746  purine nucleoside permease  90.8 
 
 		 349 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119389  normal  0.778761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5237  purine nucleoside permease  57.67 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3369  purine nucleoside permease  59.81 
 
 		 357 aa  397  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4706  purine nucleoside permease  57.67 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0697594  normal  0.247967 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5356  purine nucleoside permease  57.67 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0815  purine nucleoside permease  58.97 
 
 		 371 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4629  purine nucleoside permease  59.49 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00101608  normal  0.109746 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4914  purine nucleoside permease  57.67 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.78554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3010  purine nucleoside permease  57.67 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.435563  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0745  purine nucleoside permease  58.65 
 
 		 371 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.64688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0289  purine nucleoside transporter  58.84 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.859349  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0798  putative purine nucleoside permease protein  58.33 
 
 		 381 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0409  purine nucleoside permease family protein  58.39 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0822  putative lipoprotein  58.39 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0507  purine nucleoside permease family protein  58.39 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2138  putative lipoprotein  58.39 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1471  putative lipoprotein  58.39 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0845  CNT family concentrative nucleoside/H+ anitporter  57.56 
 
 		 358 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673784  normal  0.0511609 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2112  putative lipoprotein  57.88 
 
 		 353 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1835  putative lipoprotein  58.39 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4530  purine nucleoside permease  57.23 
 
 		 357 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4123  purine nucleoside permease, putative  53.23 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3859  purine nucleoside permease  53.23 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  normal  0.303665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3758  purine nucleoside permease  52.58 
 
 		 340 aa  341  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1496  putative purine nucleoside permease  49.51 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1619  purine nucleoside permease  48.53 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10683  purine nucleoside permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00810)  44.73 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.139964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1872  Purine nucleoside permease protein  42.67 
 
 		 364 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31020  purine nucleoside permease  41.8 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.171142  normal  0.23144 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76929  purine nucleoside permease  41.48 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.638652 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1232  purine nucleoside permease  34.88 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.25339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3260  purine nucleoside permease  35.06 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4184  purine nucleoside permease  34.43 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2226  purine nucleoside permease  32.43 
 
 		 575 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.822205  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0564  purine nucleoside permease  29.94 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1764  putative purine nucleoside permease protein  29.66 
 
 		 344 aa  123  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.319131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1321  purine nucleoside permease  30.85 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.435473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0849  purine or other phosphorylase family 1  31.23 
 
 		 329 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0917  Purine nucleoside permease-like protein  27.47 
 
 		 342 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.155546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0774  phosphorylase, putative  27.47 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.19572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2814  purine nucleoside permease  28.3 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>