13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3756 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3756  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  754    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4761  putative DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.9 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00629  hypothetical protein  45.74 
 
 		 355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.11606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2563  hypothetical protein  34.93 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.791558 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6151  hypothetical protein  36.58 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361634  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1959  hypothetical protein  26.93 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3012  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1048  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  22.1 
 
 		 363 aa  62  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1403  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 900 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405797  normal  0.0281555 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  23.81 
 
 		 719 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0765  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 669 aa  47  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000586014  normal  0.102674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2355  hypothetical protein  24.52 
 
 		 458 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  32.35 
 
 		 1162 aa  46.2  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>