17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0332 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1977  putative cellulose synthase  98.62 
 
 		 725 aa  1392    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.94511  normal  0.202937 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0963  hypothetical protein  69.5 
 
 		 721 aa  909    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.355917 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0332  cellulose synthase  100 
 
 		 725 aa  1412    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4174  putative PAS/PAC sensor protein  34.72 
 
 		 727 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4798  hypothetical protein  27.94 
 
 		 766 aa  97.4  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1313  hypothetical protein  26.61 
 
 		 875 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.240871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1568  cellulose synthase subunit B  26.47 
 
 		 880 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1368  hypothetical protein  26.24 
 
 		 881 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0776152  normal  0.0920339 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3740  cellulose synthase subunit B  26.22 
 
 		 842 aa  88.6  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0274  hypothetical protein  25.22 
 
 		 862 aa  80.9  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.237826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4804  cellulose synthase subunit B  23 
 
 		 843 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.328692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0106  hypothetical protein  23.84 
 
 		 858 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00890818  normal  0.867993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1205  cellulose synthase subunit B  22.54 
 
 		 817 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.625186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5209  cellulose synthase subunit B  24.77 
 
 		 773 aa  70.9  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00788  celB protein  22.22 
 
 		 758 aa  63.9  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5534  celB protein  31.3 
 
 		 758 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1294  cellulose synthase subunit B  21.19 
 
 		 813 aa  45.1  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>