16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3577 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  91.25 
 
 		 79 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  72.5 
 
 		 77 aa  117  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  70 
 
 		 79 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  76.92 
 
 		 77 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  54.32 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  59.42 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  42.5 
 
 		 85 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  64.29 
 
 		 67 aa  63.9  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  43.04 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  36.84 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  43.48 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1417  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267674  normal  0.202745 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>