More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2128 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2128  transposase, mutator type  100 
 
 		 155 aa  312  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.449064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3910  transposase, mutator type  89.19 
 
 		 399 aa  270  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3939  transposase, mutator type  89.19 
 
 		 399 aa  270  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0009  transposase  77.42 
 
 		 308 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0014  transposase  77.42 
 
 		 308 aa  250  4.0000000000000004e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5441  transposase mutator type  79.73 
 
 		 399 aa  246  8e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7018  hypothetical protein  79.73 
 
 		 399 aa  245  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0189  transposase mutator type  80.41 
 
 		 399 aa  244  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6755  transposase mutator type  80.41 
 
 		 399 aa  244  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500552  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5096  transposase mutator type  74.19 
 
 		 399 aa  243  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.964276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5093  transposase mutator type  74.19 
 
 		 399 aa  243  6.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0754  transposase mutator type  78.38 
 
 		 399 aa  239  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1907  transposase mutator type  78.38 
 
 		 399 aa  239  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1374  transposase, mutator type  64.19 
 
 		 398 aa  198  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4911  transposase, mutator type  62.34 
 
 		 403 aa  193  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.462522 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3126  transposase, mutator type  61.69 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601222  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3219  transposase, mutator type  61.69 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0790  transposase, mutator type  61.69 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0798  transposase, mutator type  61.69 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3185  transposase, mutator type  61.69 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0504215  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3172  transposase, mutator type  61.69 
 
 		 402 aa  191  3e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.15251  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2225  transposase IS256  60 
 
 		 398 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0464897  normal  0.902645 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1760  transposase IS256  60 
 
 		 398 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.534749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0170  transposase IS256  60 
 
 		 398 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.452529  hitchhiker  0.00578172 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2744  transposase IS256  60 
 
 		 398 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169837  normal  0.196457 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3246  transposase IS256  60 
 
 		 398 aa  189  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3612  transposase, mutator type  60.14 
 
 		 402 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0390226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3569  transposase, mutator type  60.14 
 
 		 402 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2108  transposase, mutator type  60.14 
 
 		 402 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.50702  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5445  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4031  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4226  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4182  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3966  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0157  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0266  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.598198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0343  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2394  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0944  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5067  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3714  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4069  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.291229 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3779  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.688566  normal  0.068818 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5557  transposase mutator type  56.08 
 
 		 402 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.032396 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2958  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0594  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2017  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0587  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2672  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1889  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0292  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2816  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2201  transposase, mutator type  52.56 
 
 		 406 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4171  transposase mutator type  54.79 
 
 		 384 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0112  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1531  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1539  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1513  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.688883  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1511  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.647595  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3132  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1904  transposase mutator type  47.44 
 
 		 405 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0630  transposase, mutator type  48.72 
 
 		 361 aa  145  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13671  transposase  48.72 
 
 		 409 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.967269  normal  0.0391652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  49.36 
 
 		 410 aa  144  5e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5359  transposase, mutator type  48.08 
 
 		 411 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5755  transposase, mutator type  48.08 
 
 		 411 aa  143  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3191  transposase, mutator type  48.08 
 
 		 411 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.317024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0678  transposase, mutator type  48.08 
 
 		 411 aa  141  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5979  transposase, mutator type  46.79 
 
 		 391 aa  137  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.640572 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5576  transposase, mutator type  46.79 
 
 		 400 aa  137  6e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7079  transposase mutator type  45.45 
 
 		 419 aa  127  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.870166 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10460  Transposase, Mutator family  42.68 
 
 		 422 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000746086  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10440  Transposase, Mutator family  42.68 
 
 		 422 aa  127  6e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000572407  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0221  transposase mutator type  44.81 
 
 		 419 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8623  transposase mutator type  44.81 
 
 		 419 aa  125  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331409  normal  0.594548 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4611  transposase mutator type  44.81 
 
 		 413 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.310217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3032  transposase mutator type  44.81 
 
 		 413 aa  122  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5356  transposase, mutator type  42.86 
 
 		 428 aa  118  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0116782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3590  transposase, mutator type  41.29 
 
 		 370 aa  118  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5496  transposase, mutator type  41.29 
 
 		 353 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0454  transposase, mutator type  41.94 
 
 		 353 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00300  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02160  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16090  transposase  41.29 
 
 		 390 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.559374  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20590  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00410  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00420  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03110  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.529932  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12080  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0258594  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12170  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03400  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1860  transposase mutator type  74.67 
 
 		 266 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.363503  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05430  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.236758  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20500  transposase, mutator family  41.29 
 
 		 417 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>