11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2053 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2053  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  292  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2074  hypothetical protein  68.03 
 
 		 142 aa  169  9e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.560807  normal  0.465061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1478  hypothetical protein  68.42 
 
 		 156 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3388  hypothetical protein  77.6 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2192  hypothetical protein  65.77 
 
 		 149 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.504945  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3481  hypothetical protein  54.37 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.534479 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3745  hypothetical protein  31.93 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.669424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2921  hypothetical protein  32 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384363  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2550  hypothetical protein  28.48 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0884  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0844  hypothetical protein  35.71 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  decreased coverage  0.00416761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>