22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1709 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5481  hypothetical protein  65.18 
 
 		 222 aa  280  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1073  hypothetical protein  34.27 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0074  hypothetical protein  32.65 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0592  hypothetical protein  30.58 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.323051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4094  hypothetical protein  35.51 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1796  hypothetical protein  32.9 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.322424  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1833  hypothetical protein  32.91 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2399  hypothetical protein  35.53 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0260  hypothetical protein  33.9 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.764522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1550  Protein of unknown function DUF2210  35.86 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0426394  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1506  NUDIX hydrolase  25.64 
 
 		 390 aa  67  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2288  NUDIX hydrolase  34.17 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27390  hypothetical protein  33.15 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0368828  normal  0.805501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7376  NUDIX hydrolase  34.75 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1729  hypothetical protein  32.81 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.754048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1525  NUDIX hydrolase  33.47 
 
 		 441 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3523  hypothetical protein  31.15 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.1598  normal  0.79365 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1804  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.807933  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1524  NUDIX hydrolase  30.56 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0646  hypothetical protein  30.84 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6630  NUDIX hydrolase  33.54 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.707478  normal  0.113041 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>