15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0684 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0684  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.563578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0119  hypothetical protein  87.5 
 
 		 85 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0092  conserved hypothetical protein; putative signal peptide  70.83 
 
 		 72 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0050  hypothetical protein  67.14 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0475  hypothetical protein  46.38 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1716  hypothetical protein  48.05 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.0942361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4265  hypothetical protein  60.42 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0604  hypothetical protein  53.06 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.993744  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2273  hypothetical protein  64.44 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.179364  normal  0.226669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2686  hypothetical protein  62.22 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1722  hypothetical protein  53.57 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3577  hypothetical protein  46.38 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.604321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0279  hypothetical protein  55.22 
 
 		 67 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.778649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2965  hypothetical protein  47.06 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4740  hypothetical protein  41.79 
 
 		 76 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>