51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0592 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0592  aspartate/glutamate/uridylate kinase  100 
 
 		 276 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.719802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1694  aspartate/glutamate/uridylate kinase  84.56 
 
 		 277 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  86.3 
 
 		 298 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0950  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.4 
 
 		 277 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.406129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1575  aspartate/glutamate/uridylate kinase  85.29 
 
 		 277 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0637  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.18 
 
 		 277 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3842  molybdenum storage protein alpha subunit  82.48 
 
 		 276 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1626  aspartate/glutamate/uridylate kinase  82.42 
 
 		 273 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43200  Molybdenum storage protein subunit A  79.49 
 
 		 276 aa  437  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2956  aspartate/glutamate/uridylate kinase  42.16 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0516  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.27 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.316838  normal  0.700434 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0354  aspartate/glutamate/uridylate kinase  41.13 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0347  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.93 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0638  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0949  aspartate/glutamate/uridylate kinase  44.35 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.560652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1574  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 270 aa  181  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0348  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.52 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0355  aspartate/glutamate/uridylate kinase  38.52 
 
 		 279 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3843  molybdenum storage protein beta subunit  39.93 
 
 		 270 aa  179  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1693  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.93 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0593  aspartate/glutamate/uridylate kinase  40.3 
 
 		 286 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1627  aspartate/glutamate/uridylate kinase  39.77 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43210  Molybdenum storage protein beta subunit, MosB  41.25 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2454  uridylate kinase  34.85 
 
 		 277 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1531  aspartate/glutamate/uridylate kinase  37.83 
 
 		 268 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.215337  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0932  putative uridylate kinase  37.74 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2394  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.83 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2386  uridylate kinase  36.19 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.802310000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2625  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.47 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0024261  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0277  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.7 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.366502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1890  aspartate/glutamate/uridylate kinase  34.21 
 
 		 268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0688  hypothetical protein  33.7 
 
 		 273 aa  143  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.512522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1763  uridylate kinase  28.27 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.538162 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  25.42 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0235  glutamate 5-kinase  28.36 
 
 		 383 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0211  glutamate 5-kinase  37.5 
 
 		 379 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0518  uridylate kinase, putative  34.48 
 
 		 232 aa  46.6  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1317  aspartate/glutamate/uridylate kinase  25.42 
 
 		 210 aa  46.6  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0707  uridylate kinase  24.07 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000200842 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0224  glutamate 5-kinase  28.09 
 
 		 383 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1646  uridylate kinase  25.42 
 
 		 239 aa  45.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  26.97 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  26.14 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2011  uridylate kinase  25.55 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  24.28 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  26.13 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  26.13 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  28.02 
 
 		 246 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1004  uridylate kinase  26.92 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000758242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  29.63 
 
 		 234 aa  42.4  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10140  uridylate kinase  29.17 
 
 		 250 aa  42  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.956696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>