21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2035 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2035  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 312 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0583633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0608  hypothetical protein  26.34 
 
 		 337 aa  54.3  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3641  hypothetical protein  30.72 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1187  dienelactone hydrolase  43.1 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1130  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  29.44 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5405  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 		 274 aa  46.6  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0752119  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  30.07 
 
 		 259 aa  46.2  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  27.92 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  28.85 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 424 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2781  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  31.2 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  27.27 
 
 		 213 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  31.11 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1040  dienelactone hydrolase  35 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  25.71 
 
 		 354 aa  43.5  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  23.44 
 
 		 436 aa  43.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  31.08 
 
 		 327 aa  43.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4844  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.54 
 
 		 332 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  29.63 
 
 		 490 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>