19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1970 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1970  hypothetical protein  100 
 
 		 84 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2412  hypothetical protein  58.62 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0165  hypothetical protein  59.02 
 
 		 65 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2351  hypothetical protein  54.29 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.346428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4550  hypothetical protein  52.38 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1930  hypothetical protein  48.28 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0186  hypothetical protein  64.71 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0644  hypothetical protein  61.11 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.335995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1789  hypothetical protein  55.56 
 
 		 41 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00105289  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4587  hypothetical protein  52.78 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.267053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1508  hypothetical protein  43.64 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.265609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3622  hypothetical protein  55.88 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1605  hypothetical protein  43.4 
 
 		 54 aa  42.7  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000330162  hitchhiker  0.0000142519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1687  hypothetical protein  43.64 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.579492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04672  hypothetical protein  55.56 
 
 		 74 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2337  hemin uptake protein-like protein  39.34 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3132  hypothetical protein  51.35 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10143  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4165  hypothetical protein  35.82 
 
 		 69 aa  41.2  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1441  hemin transport system, hemin uptake protein  55.88 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>