27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4618 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4618  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  190  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.549833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0792  hypothetical protein  92 
 
 		 100 aa  176  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.576927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0869  hypothetical protein  83 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0737512  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0463  hypothetical protein  78.79 
 
 		 101 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0554  hypothetical protein  77.78 
 
 		 101 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0752  hypothetical protein  77.78 
 
 		 99 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.138316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0797  hypothetical protein  67.96 
 
 		 102 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.763235  hitchhiker  0.00476248 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1466  hypothetical protein  51.76 
 
 		 89 aa  94  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0401  hypothetical protein  47.56 
 
 		 88 aa  77.4  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3808  hypothetical protein  47 
 
 		 118 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0320919 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0196  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0225  hypothetical protein  44.83 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1070  hypothetical protein  44.19 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.215268 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0322  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0308  hypothetical protein  42.68 
 
 		 88 aa  70.5  0.000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3348  hypothetical protein  41.3 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.682693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3476  hypothetical protein  41 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.404419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3152  hypothetical protein  43.02 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412403  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3260  hypothetical protein  38.95 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.161528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0095  hypothetical protein  39.47 
 
 		 87 aa  62  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0589  hypothetical protein  39.51 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4533  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.561656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0451  hypothetical protein  41.86 
 
 		 90 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00606209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0541  hypothetical protein  35 
 
 		 117 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.752321 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0158  hypothetical protein  47.67 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.749446 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1035  hypothetical protein  34.57 
 
 		 91 aa  50.8  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.537516  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0526  hypothetical protein  32.04 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.613897 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>