28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1531 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  41.21 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  37.23 
 
 		 230 aa  119  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4591  methyltransferase  37.16 
 
 		 158 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287622  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  30.56 
 
 		 241 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  34.29 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  37.23 
 
 		 324 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  25.68 
 
 		 236 aa  62  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  30.52 
 
 		 382 aa  60.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  31.07 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3365  hypothetical protein  26.92 
 
 		 246 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.668804  normal  0.0254427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  29.68 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  29.45 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  29.27 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  30.3 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  28.31 
 
 		 303 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  24.87 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  30.71 
 
 		 434 aa  47  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  26.56 
 
 		 301 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  27.95 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  30.71 
 
 		 434 aa  46.2  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  28.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  29.32 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2182  macrocin-O-methyltransferase  27.48 
 
 		 166 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.321151 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  21.85 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.02 
 
 		 246 aa  42.7  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3953  hypothetical protein  25 
 
 		 246 aa  42  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.686057  normal  0.654458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>