26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0968 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0968  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  610  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1072  hypothetical protein  90.33 
 
 		 300 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5102  hypothetical protein  75.33 
 
 		 300 aa  485  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4464  hypothetical protein  70.53 
 
 		 301 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3634  hypothetical protein  62.94 
 
 		 298 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.651721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0218  hypothetical protein  57.19 
 
 		 280 aa  318  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.776931  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0409  hypothetical protein  52.16 
 
 		 284 aa  315  4e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.991789  normal  0.340922 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1586  hypothetical protein  52.74 
 
 		 281 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1259  hypothetical protein  50.7 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.495677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1543  hypothetical protein  50.7 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1457  hypothetical protein  52.58 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00609075 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1416  hypothetical protein  50.35 
 
 		 280 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0999  hypothetical protein  46.26 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0735547  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1571  hypothetical protein  43.6 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0110  hypothetical protein  44.29 
 
 		 290 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.907911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5905  hypothetical protein  40 
 
 		 288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2193  hypothetical protein  43.06 
 
 		 276 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0957966  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3597  hypothetical protein  42.34 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0542  hypothetical protein  41.87 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218634  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1245  hypothetical protein  44.13 
 
 		 277 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.806576 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01370  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1418  hypothetical protein  25.26 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.318013 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0276  hypothetical protein  27.54 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  23.91 
 
 		 552 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  23.91 
 
 		 552 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0632  hypothetical protein  23.22 
 
 		 514 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.489107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>